Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms