Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms