Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms