Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms