Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX1Q9NSU2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX1Q9NSU2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX1Q9NSU2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX1Q9NSU2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX1Q9NSU2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX1Q9NSU2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX1Q9NSU2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX1Q9NSU2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms