Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC22A11Q9NSA0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms