Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX15Q9NRS6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms