Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA4BQ9NPR2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms