Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPAG4Q9NPE6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPAG4Q9NPE6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms