Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPIFA1Q9NP55 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms