Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC3GQ9HC16 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms