Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAGR1Q9BTK6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAGR1Q9BTK6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms