Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNL2Q96S94 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNL2Q96S94 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms