Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms