Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD2Q969F2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms