Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDAQ92838 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDAQ92838 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDAQ92838 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDAQ92838 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDAQ92838 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDAQ92838 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EDAQ92838 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EDAQ92838 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EDAQ92838 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDAQ92838 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDAQ92838 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDAQ92838 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDAQ92838 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDAQ92838 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDAQ92838 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms