Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms