Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM41Q8WV44 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM41Q8WV44 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms