Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf43Q8TAL5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms