Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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ZNF248Q8NDW4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ZNF248Q8NDW4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ZNF248Q8NDW4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ZNF248Q8NDW4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ZNF248Q8NDW4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF248Q8NDW4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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