Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms