Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUP54Q7Z3B4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms