Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms