Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms