Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM78BQ5VT40 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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