Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARHGAP40Q5TG30 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms