Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HSD17B12Q53GQ0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms