Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTLL9Q3SXZ7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms