Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms