Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms