Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms