Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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PTPROQ16827 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTPROQ16827 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTPROQ16827 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTPROQ16827 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTPROQ16827 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PTPROQ16827 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PTPROQ16827 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPROQ16827 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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