Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMA3Q16787 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMA3Q16787 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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