Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CLPPQ16740 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms