Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB1Q16531 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDB1Q16531 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms