Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSRP2Q16527 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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