Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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