Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SIX1Q15475 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SIX1Q15475 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SIX1Q15475 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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