Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCM1Q15154 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCM1Q15154 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms