Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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