Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHPRHQ149N8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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