Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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CHD4Q14839 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CHD4Q14839 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CHD4Q14839 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CHD4Q14839 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHD4Q14839 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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