Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSPNQ14714 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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