Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2H3Q13889 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms