Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SPTAN1Q13813 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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