Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL4AQ13619 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms