Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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