Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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