Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE3BQ13370 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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