Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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IFT88Q13099 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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IFT88Q13099 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFT88Q13099 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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